Kismolekulák 3D-ben

Letölthető anyagok - 2014. március 7.

Írta: Nádori Gergely

metánA szerves kémiában nagyon hasznos, ha sikerül térben is elképzeltetni a diákokkal, hogyan épülnek fel a molekulák. Sokat segít a molekulamodellező készlet, a kalott modell, de arra is szükség lehet, hogy a molekulákat a monitoron, interaktív táblán mutassuk be. Ebben segíthet a Virtual CHemistry oldal (IDE KATTINTVA), ahol számos kis szerves molekula virtuális modelljét tölthetjük le. A modellek úgynevezett pdb állományok és többféle programmal is megjeleníthetők.

  • Nem túl fiatal program, de az igényeinknek teljesen megfelelő lehet a Rasmol, ebbe a programba betölthetjük a pdb állományt, forgathatjuk, nagyíthatjuk, nézegethetjük.
  • A Rasmol továbbfejlesztésével jött létre a Rastop, kicsit szebb, bár a lehetőségeinek nagy részét nem a kisebb molekuláknál, hanem a fehérjék nézegetésével tudjuk kihasználni.
  • A ProteinScope érdekessége, hogy ezzel akár 3D-ben nyomtathatjuk is a molekulákat.
  • Remek választás lehet a teljesen Java alapú Jmol.

Ha valaki komolyabb molekulákra (főként fehérjékre) vágyik, a Protein Data Bank oldalon érdemes körülnéznie. Ennek az oldalnak van kifejezetten oktatási változata is a PDB-101.